生物有機肥通過三種途徑減輕作物病害:一是肥料中的功能性微生物生長繁殖,在作物根際土壤微生態(tài)系統(tǒng)內(nèi)形成優(yōu)勢種群,抑制其它有害微生物的生長繁殖,甚至對部分有害病原菌產(chǎn)生拮抗作用,減少了有害微生物的危害機會。二是功能性微生物在生長繁殖過程中向作物根際土壤微生態(tài)系統(tǒng)內(nèi)分泌各種代謝產(chǎn)物,這些代謝產(chǎn)物能夠刺激作物生長,提高作物抵抗不良環(huán)境的能力。三是生物有機肥營養(yǎng)元素全面,作物植株生長健壯,具有良好的株型和合理的群體,增強作物的抗病性,減少病害的發(fā)生。如白菜試驗,施用生物有機肥軟腐病發(fā)病率為2%,而蔬菜專用肥和干燥雞糞分別為17%和20%。